神奇宝贝剧场版即日本动漫神奇宝贝的电影版，一般日本每年七月份都会首轮放映。目前已有17部剧场版上映，如《超梦的逆袭》、《路基亚的爆诞》、《结晶塔的帝王》等。剧情集中于神奇宝贝和小智一行人，也可能会有传说中的神奇宝贝为电影的特点，故事的背景是以日本外边的现实世界的地方为原型。剧中小智一行人通常是当时播放的动画版的队伍，手持神奇宝贝也与动画版一致，在神奇宝贝无印篇初期的四部电影版中，剧情仍然隶属于动画版的剧情延伸和补充，但是由于之后剧场版经常会与动画版出现剧情和设定上的冲突，所以制作组开始设定为电影版与动画版的剧情相对独立，但是也有部分剧场版会在动画剧集中出现彩蛋性质的联动桥段（如神速的盖诺赛克特 超梦觉醒）。

神奇宝贝剧场版

ポケットモンスター剧场版

神奇宝贝电视动画的电影版

剧场版

皮卡丘短片

主题歌曲

历年简介

主条目：超梦的逆袭

这天，当小智与训练家的战斗结束之后，他们收到一封由快龙送来的神秘招待券。招待券里面写着：‘你们是最被看好、最有前途的神奇宝贝训练家，我以最强的神奇宝贝训练家的身份，邀请你们来参加我的宴会。’“最强的神奇宝贝训练家？”好奇的小智他们毫不考虑地朝向新岛的神奇宝贝城出发！当一行人到达港口时，却因为天候不佳，前往新岛的船只暂停行驶。港口管理员波佳为了不让神奇宝贝和他们遭到任何的意外，坚决不让众人出航，女警君莎也赞同波佳的看法。

一位名叫海男的男孩，他打算搭乘神奇宝贝渡海，而另外两位训练家空男和小甜也附和海男的作法，搭乘神奇宝贝渡海。正当小智烦恼无法前往新岛之际，港口出现了一艘小船，船上维京人打扮的船家答应在小智他们渡海。正当众人在海中央之时，突然一个大浪打来，让操纵小船的船家露出了真面目。什么？竟然是火箭队那三个捣蛋鬼！！正当火箭队要说出那套可爱又迷人的台词之时，小船竟然被大浪打翻了！小智和小霞赶紧叫出杰尼龟和宝石海星让众人紧捉，才不至于被大浪卷走。

在到达新岛之后，一名很像神奇宝贝中心护士乔伊的女子带领小智一行人前往神奇宝贝城。海男、空男和小甜果然已经到了。当领路的女子介绍最强的神奇宝贝训家出场时，没想到出现在众人面前的竟然是……超梦？[1]

主条目：梦幻之神奇宝贝洛奇亚爆诞

南海小岛上有个传说，火之神、冰之神、雷之神被人类触怒之时，就是世界毁灭的日子。

疯狂的收藏家吉尔露太为了引出传说中的海之神洛奇亚，捕捉了亚西亚岛的火焰鸟，导致世界各地开始出现天灾地变的异象。这时正好小智一行人来到亚西亚岛，并在当地庆典活动中被推举扮演传说中的控制者。控制者必须到神鸟的三座岛屿中取得三种宝藏，在取宝藏的过程中，小智目赌神鸟被吉尔露太抓走。

疯狂收藏家吉尔露太为了个人私欲不顾世界的存亡固然令人气愤，可是当神鸟被小智释放后，竟不顾一切的展开疯狂攻击。眼看着世界末日的预言真的要实现…。

主条目：结晶塔的帝王

在一个名为绿色草原的美丽地方，居住着一位名为小美的年幼少女，她的母亲在多年前失踪，而她的父亲则是一位研究unknow的科学家（unknow=未知图腾）。后来，小美的父亲在某次研究中失踪。

孤独的小美用爸爸研究所遗留下来的刻着未知图腾样子的骨牌拼出了一个图形，根据unknow酷似英文字母的形态可推测她所拼出的是：MP A P AM EA

(由于格式原因，百度无法显示原词，原词横排为PAPA和ME，竖排为MAMA

几个单词交错在一起，含义为：爸爸妈妈与我在一起。

谁知那骨牌中封印着unknow，unknow感觉到小美孤独的内心，创造出了美丽的结晶塔，以及炎帝来替代她的父亲（小美从爸爸那听来了关于炎帝的传说，一直很喜欢炎帝，因为她觉得炎帝就好像爸爸一样温柔而又可靠）。小美认为是爸爸变成了炎帝回来找她。而炎帝也将小美当做亲身女儿一般呵护有加，满足她的一切愿望。结晶塔，成了小美独自的世界，让她沉浸在幻想的快乐中。

小智一伙在旅途中来到了绿色草原，但这里却已经成为结晶的世界……而小智的母亲被炎帝掳走（小美以为她是自己的妈妈，央求炎帝将她带回来）

监视小智一伙的小美看到了他们的神奇宝贝而羡慕不已，unknow便使小莉瞬间分身并成人化，与小智他们进行神奇宝贝对战。认出成人化小美的小刚与他进行第一场战斗，小智他们则继续往上寻找妈妈。之后小刚完败，小莉追上与小霞战斗，小智继续往上终于找到了妈妈，而妈妈也早就恢复了意识，她告诉小美事实的真相，希望她醒悟过来，小美陷入了在真实与美好的抉择中，痛苦不已，unknow力量大爆发，炎帝也赶到与小智战斗。

小智的口袋妖怪与炎帝展开了激烈的战斗，但在力量强大的炎帝面前却显得手无缚鸡之力，毕竟炎帝是传说中的神奇宝贝，乃守护凤凰的三神兽之一，——火山的化身。幸亏此时为了帮助小智的喷火龙及时赶到，利用强大的火焰攻击与飞行能力不断攻击。小智劝说炎帝让小美离开结晶塔：“如果她一直呆在结晶塔中，或许她会快乐，但她将会是永远孤单一个人！”炎帝渴望实现小美愿望的心有了一丝动摇，但最终炎帝还是凭借着unknow神奇的力量打败了喷火龙，就在要解决喷火龙的一瞬，小美终于醒悟，阻止了炎帝，正在这一切向大结局发展的时候，unknow却因失去了小美的意识而暴走了！炎帝帮助小美与小智他们一路脱逃，来到了unknow的所在地，但所有的攻击在unknow群的精神力量下全都无效。最后，炎帝决定帮助小美实现最后的愿望——离开结晶塔，舍身攻击，在小美的信赖下，炎帝使出浑身解数，终于打乱了unknow的活动，而炎帝却渐渐消失在万丈光芒之中。结晶塔恢复了原样，小莉的爸爸妈妈（片尾曲中出现的那位女子，根据小美在见到她后的表现可推测出她是小美的母亲）也回来了，只是那存在又消失了的炎帝，到底是真身还是一个瞬间的幻影呢？我们不得而知……等等

主条目：雪拉比穿越时空的遭遇

在电影开始开篇，场景被设置在40年前的一片大森林中。一个叫小羽的男孩想进去那个森林去画画,在森林内,小羽遇到了被神奇宝贝猎人追捕并受重伤的雪拉比,当他们被神奇宝贝猎人追的走投无路的时候,雪拉比带着小羽到了40年后(也就是现代),正好小智他们在这森林里,他们救了小羽,小羽告诉了小智他们关于雪拉比的事,小智他们救了雪拉比,并和他成为了好朋友.

与此同时，火箭队的三干部之一比夏斯也在寻找着并打算捕猎雪比拉。他

比夏斯拥有能将一切神奇宝贝变得凶恶的黑暗球，将雪拉比自小智他们的身边夺走。为了拯救被比夏斯捕捉的雪拉比，小智与小羽拼命奋战。可是，温柔的雪拉比已经发生了很大的变化……

激烈的对战中，传说中的神奇宝贝水君出现了！小智们能否拯救雪拉比和森林呢！？

主条目：水都的守护神拉帝亚斯和拉帝欧斯

水都，小精灵水上冲浪比赛，拉提亚斯想帮小智，结果小锯鳄却走错方向。小霞以微弱差距获得冠军。

亚军载小智等人游览水都，并讲述这个城市的美丽传说。

发现桑兰与莉奥的火箭队，决定先她们一步，成为新的小偷NO.1。

桑兰与莉奥追捕变成人形卡侬的拉提亚斯，小智英雄救美，拉提亚斯跑得无影无踪。

小智等人参观博物馆，看到真正卡侬，小智上前搭话，被骂。小智一路追赶卡侬，又遇到了变成人形卡侬的拉迪亚斯，被带入神秘花园。

小智与卡侬和博物馆的爷爷化解误会，了解心灵水珠的美丽传说，回去与小霞、小刚汇合。

桑兰与莉奥行动开始！拉提奥斯为了救拉迪亚斯被抓住，心灵水珠也被抢走。拉迪亚斯变成人形跑去找小智求援，在小霞、小刚面前现出真实面目。

武藏小次郎依然肩负起跑龙套的重任……

莉奥利用拉迪奥斯与心灵水珠的力量开始发飙。

小霞、小刚被突然出现的铁栅栏困住，小智与拉迪亚斯勇往直前，摆脱复活的化石神奇宝贝的追杀，终于救出拉迪奥斯，但此时心灵水珠借由古代机器发动的巨大潮水即将摧毁城市……

已是奄奄一息的拉迪奥斯为了保护水都和妹妹而牺牲。

小智等人将心灵水珠放回原位。

最后，码头边，变身成为卡农的拉提亚斯（官方解释）送给小智一幅画，在小智脸旁一吻告别……

当然还有，桑兰与莉奥在牢中继续研究着她们未来的小偷事业，武藏小次郎则继续着他们未来的跑龙套事业……

主条目：七夜的许愿星基拉祈

千年一次的彗星之夜里，愿望将会实现……

立志成为出色的神奇宝贝训练师的小智、小遥和小胜，带着皮卡丘展开了新的旅程。为了观看千年彗星出现的刹那，来到恩斯游乐场，并认识魔术师巴特勒与戴安。在魔术表演中，小胜听到一阵细微的呼唤声…

那是在〝沉眠之茧〞中沉睡了千年，可帮助人类达成愿望的神奇宝贝——基拉祈。在千年彗星出现的夜晚，如果遇到拥有纯真心灵的伙伴便会苏醒。为了让基拉祈醒来，巴特勒请小胜当基拉祈的伙伴，果然，基拉祈从万花镜般的光芒中苏醒过来。

虽然基拉祈只能停留短暂的七日就会再消失，但是头一次拥有属于自己的神奇宝贝的小胜，对基拉祈却非常宠爱。充满野心的魔术师巴特勒，因为知道基拉祈具有神奇的力量，便把基拉祈给抢走，并且想利用他来完成愿望。

不怀好意的巴特勒，他的愿望是什么呢？小智与小胜要如何克服困难，成功救出同伴呢？小胜与基拉祈又会面临怎样的生离死别呢？ 

主条目：裂空的访问者代欧奇希斯

四年前被烈空坐消灭的代欧奇西斯，四年之后来到科技发达的拉罗斯市，而小智皮卡丘等人也来到这里，在那里，他们遇到了少年托伊，托伊因为四年前的事情留下阴影而不敢与宠物小精灵接触（代欧奇西斯的宇宙落下导致小精灵们的逃跑吓怕了托伊）来到拉罗斯市的迪欧西斯是什么？托伊的心结能否解除？

正当他们努力想让托伊克服恐惧时，忽然，消失四年的代欧奇西斯又再度出现！小智一行人和托伊也再次体会到迥然不同的惊异体验和惊心动魄的冒险。在这极光般的舞台中，烈空坐和代欧奇西斯再度卯足全劲地互相激战，可说是魄力百分百！究竟烈空坐和代欧奇西斯的战斗会如何？而代欧奇西斯这次回来究竟要的是什么？最后又会发生什么令人意想不到的意外危机呢？ [2]

主条目：梦幻与波导的勇者路卡利欧

持续旅行的小智皮卡丘一行，来到了流传着「波导传说」的城镇：欧鲁德朗城。在城市的中心，举行着对数百年前的“波导之勇者——亚郎”而举行的祭典。小智与皮卡丘决定参加今年勇者对战。激烈的战斗之后，获得了冠军的小智当选为当年“波导之勇者”。城中举办了庆祝优胜者的盛大宴会。突然幻之宠物小精灵“梦幻”出现。然而梦幻却带着皮卡丘消失了身影。与此同时，“迷之宠物小精灵”「鲁卡利欧」数百年前的封印被解开，在小智面前显现了身影的！皮卡丘在哪？梦幻的目的是什么？还有，隐藏在鲁卡利欧身上的过去和波导传说的秘密是什么？带者所有谜团，小智与鲁卡利欧一起朝向<世界初始之树>开始了冒险。

主条目：神奇宝贝保育家与苍海的王子玛纳霏

在这世界上海洋某处，即将诞生一只谁都不知道的传说神奇宝贝。以广大的海洋为舞台，神奇宝贝史上最大的任务即将开始！在荒地迷路的小智一行人遇到了一位女性“广美”，以水中神奇宝贝表演而出名的码头巡回团明星。

广美是水之民的后裔，可以体会水系神奇宝贝的内心。小智等人便听广美诉说着水之民流传已久的传说。原来在海洋某处，水之民一族建造了“海之神殿-亚库夏”，里面供奉隐藏着珍宝“海之王冠”。

但目前据说谁也没看过这顶王冠的实体模样。这时，追寻着传说之谜的神奇宝贝援助员“杰克·渥克”(昵称杰奇)出现了。原来杰奇正执行一项机密任务，那就是要把苍海的王子──玛纳霏的蛋给安然送进神殿里。于是广美和小智等人也协助这项任务。忽然这时！出现了有“魅影”之称的海盗船长开来的大型潜水舰。原来魅影想要夺取王冠，借住王冠的神力来策划征服世界。但是要解开王冠隐藏的谜团，似乎还需要靠玛纳霏的蛋。这时连火箭队都想过来分一杯羹，造成了大混乱！

为了抵制魅影的阴谋，杰奇开始用捕获器借住许多神奇宝贝的力量，小智他们也拿出自己的神奇宝贝准备应战。但毕竟对方的高科技潜水舰威力太强，顿时陷入危机！神秘的蛋此时发出灿烂的光芒，玛纳霏终于诞生了！隐藏于王冠珍宝里的秘密是？而玛纳霏的神秘力量又是？最后杰奇和小智等人的任务究竟能不能圆满成功呢？！现在，准备朝向海之神殿-亚库夏，目睹这精采的冒险吧！

主条目：决战时空之塔帝牙卢卡VS帕路奇犽VS达克莱伊

为了参加下一个小精灵竞技赛，小智一行来到了阿拉莫斯镇，在那里遇见了一位名叫艾丽丝的可爱少女。艾丽丝带他们参观了小镇的标志建筑——时空之塔和水树相映成趣的美丽庭园。抱着观光的心情而去的小智一行却偶然遭遇庭园被不明生物袭击的事件。这个小镇有权有势的艾伯特男爵也出现在那里，他一口咬定这是传说中的小精灵——达库莱伊所为。不久，达库莱伊突然从可怕的幻影中现身于小智等人的面前。

未知的小精灵，达库莱伊，它到底从何而来？正当那时，迪亚路加和帕鲁奇亚在时空夹缝中的战斗蔓延开来。

强大的力量相互冲撞，将空间撕裂。并且，从裂口正好能看见阿拉莫斯镇的所在位置。在和迪亚路加的战斗负伤的帕鲁奇亚逃到了这个小镇。但是，感觉到帕鲁奇亚存在的达库莱依立刻对它展开了攻击。这时，追赶帕鲁奇亚而来的迪亚路加也出现在阿拉莫斯镇。被称为神的两只小精灵与达克莱依相遇之时，震撼时空的史上最强战斗开始了。

即时强烈的冲击让阿拉莫斯镇岌岌可危，不久便面临崩溃的危机。“古狄的日记”中记载的预言即将成为现实。

小智等人能否解除这个危机呢！？结果达库莱伊是敌人还是盟友呢？！「奥拉希翁」究竟是什么呢？ 

主条目：骑拉帝纳与冰空的花束洁咪

[反转世界]...是存在于这个世界内部的镜子般不可思议的世界。那个美丽而规则的世界，是冥王龙栖居的特殊空间。然而迪亚鲁加和帕鲁其亚的战斗造成了时空的扭曲，反转世界也因此完全被阴霾笼罩。由于自己的世界被污染而被激怒的冥龙找到了迪亚鲁加，并想将其拖入反转世界中。

另一方面，在继续旅行的小智和皮卡丘一行的面前出现了一个小小的，几乎看不见的精灵。那是有[花媚]之称的感谢神奇宝贝雪米。被卷入迪亚鲁加和基拉提那的战斗的雪米在千钧一发之际从反转世界逃出。小智一行带着精疲力竭的Shaymin前往神奇宝贝中心。

雪米用心电感应将小智一行带到了它的格拉西玳亚(グラシデア)花园，并告诉他们在这[格拉西玳亚之花]中隐藏着巨大的秘密。正准备离开神奇宝贝中心的小智等人遇到了前来捕捉雪米的火箭队。而与此同时，神奇宝贝中心外的装饰品的镜面上出现了[次元旋涡]，将火箭队、雪米连同小智一行人一起全部带往了反转世界。

从次元旋涡中脱出的小智一行人环顾四周，这里是倒立着一排排建筑物，空中处处漂浮着乌云的，广大而不可思议的反转世界。

就在这时，基拉提那突然出现，向雪米发动攻击。小智等人正要与基拉提那对抗，却传来制止之声。说话者是名叫无限的学者，他告诉小智等人不可以让基拉提那生气。

正在小智一行在无限的帮助下向现实世界回返之时，企图利用基拉提那的力量支配世界的，驾驶着高科技母舰[百万力霸]的谜之青年，ZERO出现了。和雪米一起继续着探索花园之旅的小智一行没能逃过ZERO的追踪。

...前所未有的冒险之旅的高潮，等待着你的是超越想像的“美丽奇迹”。

主条目：阿尔宙斯超克的时空

继续旅行的小智一行来到了四周环绕着丰富自然景观的河畔之城米琪那。这座城中有几千年前的神殿遗址，小智一行向位于巨大岩山上的遗迹前进。岩山山顶有一片巨大的湖，遗迹就建在湖边。小智一行陶醉在美丽的湖光之中。然而，湖面波澜骤起，水上形成了龙卷风，向小智一行迫近。眼看就要被龙卷风卷起来的时候，忽有一位女子伴着[迪亚鲁加，拜托你了！]的声音出现。下一个瞬间，空间被割裂开，迪亚鲁加的身影出现…女子名叫西娜，是遗迹的守护者。据说她有和神奇宝贝心意相通的能力。西娜将小智一行引入遗迹，用时空仪逐一介绍了迪亚鲁加、帕鲁奇亚和冥王龙的空间，然后又开始将米琪那镇的古老传说娓娓道来…

一切要从上古时代，相传创造了万物的幻之神奇宝贝亚尔修斯为救许多神奇宝贝而撞向陨石的事情说起……

一改以往的风格，本片的背景转化为希腊的雅典卫城，那一座座古老沧桑的建筑一定会让你有一种耳目一新的感觉，登场的神奇宝贝最有看头的莫过于阿尔修斯了，它被誉为神奇宝贝中的“万神之神”，其强大的能力不可估量。然后是与所有前作有着“跨世纪”的改变的“众神之战”。前两部呕心沥血描绘的神兽的形象，在这神奥三部曲的最终章大放异彩。人物的设计也与之前有了很大不同的风格。这回给我们上演什么样的好戏呢？

主条目：幻影的霸者佐罗亚库

在每年一部的《神奇宝贝》剧场版面前也难以匹敌（战绩请看：日本动画电影历代票房收入排行榜2007日本剧场版动画票房十强出炉），作为系列的第13弹作品，《宠物小精灵》动画电影《剧场版 幻影的霸者 佐罗亚库》将于2010年7月10日起在全日本东宝系新片隆重上映！

王冠市是个水与绿茵、古街道与近代建筑完美调合的城市。为了观看正在这里举办的“神奇宝贝足篮世界杯”，小智一行人向王冠市前进。在途中，他们遇到了一只能够化身其他神奇宝贝或人类、名为“索罗亚”的不可思议的神奇宝贝。

索罗亚还会心电感应，为了帮助同伴，它告诉小智它也要前往王冠市。小智们决定要栛助索罗亚，一起结伴同行。

另一方面，幻之神奇宝贝雪拉比在相隔20年再度现身王冠市的同时，王冠市却发生了一起奇妙的事件。原本应该是这座城市的守护神－传说的神奇宝贝雷公、炎帝、水君竟在街道上大搞破坏。

原来这个事件的背后，隠藏着大企业的社长克林克斯·寇泰的邪恶计画。从前，曾经利用雪拉比的神秘力量获得财富与权力的寇泰，为了再度取得这个力量，他故意制造王冠市的混乱，好让雪拉比掉入他的圈套。

而变身为传说的神奇宝贝引起暴动的，是能够操控幻影的神奇宝贝“索罗亚克”。

然而，索罗亚克竟然是索罗亚正打算前往栛助的同伴！而利用索罗亚克变出的幻影，寇泰则不停地追逐著雪拉比。再这样下去，雪拉比和王冠市真的很危险！小智们将为此展开行动…。

雪拉比拥有的秘密力量是什么呢？雪拉比和王冠市的命运将会如何呢？索罗亚能够平安拯救索罗亚克，和它再度相逢吗？

主条目：比克提尼与黑英雄捷克罗姆/比克提尼与白英雄雷希拉姆

在合众地方旅行的小智与皮卡丘、艾莉丝和天桐，来到了城中央有称为“大地之剑”的城堡的城镇アイントオーク。这个城镇，从前以被称为“大地之民的王国”为荣，但如今却已经衰退。小智一行人来到此地参加丰收祭纪念对战大会，在这里他们遇到了能够给人类和神奇宝贝带来不可思议的力量的梦幻之口袋妖怪，ビクティニ，并与它成为了好朋友。 以复活王国为愿望的大地之民的后裔，ドレッド·グランギル，计划使用ビクティニ的力量来移动大地之剑。然而受此影响，アイントオーク就会卷入灾难性的异变。 如果到了那一步，小智一行能否将城镇从危机中拯救？ビクティニ的命运会？捷克罗姆·雷希拉姆又有怎样的谜，神奇宝贝史上最大的感动的冒险，一定会让你惊叹！

主条目：酋雷姆VS圣剑士凯路迪欧

小智与皮卡丘、艾莉丝、天桐一行人正搭乘火车前往洛祥的旅途中，在行经山区时发现一只从未见过的神奇宝贝，但它却受了伤一动也不动。

其实它正是被称为三位圣剑士的后继者，梦幻的神奇宝贝‧凯路迪欧。

就在此时，最强的龙系神奇宝贝酋雷姆突然来袭！面对能变换成焰白酋雷姆与闇黑酋雷姆两种型态，并拥有压倒性力量的酋雷姆，小智一行人千钧一发逃过酋雷姆的追击。

凯路迪欧无视三位圣剑士的忠告，执意要向酋雷姆挑战。然而见识到酋雷姆的强大力量之後，凯路迪欧在无比恐惧之下逃走了！

三位圣剑士为了要救凯路迪欧，不小心被酋雷姆的攻击冰冻了起来。

为了救出同伴再度振作起来的凯路迪欧，以及在一旁鼓励的小智一行人。他们能否平安度过这次的危机呢？为了拯救同伴，真实的力量、诚挚的勇气以及小智一行人的友情，将唤起凯路迪欧未知的力量！

主条目：神速的盖诺赛克特超梦觉醒

2012年12月，「神奇宝贝」剧场版动画情报发表，该作正式标题为「神速的盖诺赛克特」，预计将于2013年7月13在日本上映，导演依然是该系列的执导者汤山邦彦，与此同时「皮卡丘和伊布☆Friends」短篇动画也将同时上映。「神速的盖诺赛克特」的特报映像已经公开！

即将于2013年7月上映的剧场版是「神奇宝贝」系列的第16部剧场版动画，上一部作品名为「酋雷姆VS圣剑士」，而新作则是以被真红之铠包裹着，曾在3亿年前被等离子团改造了的口袋妖怪盖诺赛克特为主角，在特报中登场的正是被称为「红色盖诺赛克特」的口袋妖怪，它比平常的盖诺赛克特行动更快速，能力更强劲！尤其是在「高速飞行行态」下时，更是为神速！而剧场版中它将如何活跃，又会与小智一行展开怎样的互动呢？

近期东京电视台早安演播室节目公开了今年神奇宝贝电影版的新海报和预告片，预告片中，小智一行人来到纽托克市，遭遇了盖诺赛克特作乱破坏的情景，而此时超梦出现并阻止盖诺赛克特。预告片中称「你还不了解真正的《超梦》」。

主条目：破坏之茧与迪安茜

“钻石矿国”。那是埋藏在深深的地下，“宝石神奇宝贝”メレシー们平静生活的美丽国度。

在这个国度中，有一个被称为“神圣钻石”的巨大钻石。圣之钻是维持矿国的重要能量来源，长期以来一直履行着这个使命。而创造出这个钻石的是，这个矿国的公主迪安茜。不过，她已经不再有曾经拥有的力量。

然后…这个时刻到来了。“神圣钻石”的生命几乎快要耗尽了。这个如此美丽的矿国将要毁灭了！就在这个时候，迪安茜遇到了小智与皮卡丘，他们决定一起寻找拥有神圣力量的生命神奇宝贝泽尼亚斯。

在旅途中，女盗贼玛丽莲和忍者盗贼莱欧特，以及火箭队三人组为了夺取迪安茜的能力，袭击了他们。

借助蜜莉丝·阿尔加斯亲子的力量，一行人解除了危机并继续他们的旅途，结果他们发现了曾经消灭了卡洛斯地方所有生命的破坏神奇宝贝伊维塔尔沉眠的茧，被它挡住了去路——。

在这紧迫的危机中。迪安茜能否拯救自己的国度呢？以及，小智和皮卡丘的命运会如何？

主条目：光轮的超魔神胡帕

100年前，沙漠都市迪塞尔市因为口袋妖怪之间的战斗而遭受严重破坏。战斗起因是那只口袋妖怪。但是，这只口袋妖怪后来被某人封印了，城市重回和平并且今天仍然健在。

在小智与皮卡丘一行人的旅途中，他们遇到了持有可以召唤万事万物的光轮的幻之口袋妖怪胡帕，以及照顾他的少女玛丽。

幻之口袋妖怪胡帕开始用他的光轮传唤出各种各样的东西，包括他最喜欢的食物甜甜圈，这让大家都很惊讶和高兴。喜欢恶作剧的天真单纯的胡帕称呼小智和皮卡丘为傻多和皮卡。大家很快成为伙伴并一同旅行。

一到迪塞尔市，众人就遇到了玛丽的哥哥巴尔扎，但是巴尔扎的样子却很奇怪。走近一看，发现他手中握有封印了曾经破坏城市的某只口袋妖怪的道具监狱之瓶。

一股邪恶的气息从瓶中溢出。经过漫长的时间，封印好像已经被解开了。就在那时，传说中的口袋妖怪从邪气中飞出。原始固拉多，原始盖欧卡，迪奥鲁加，帕鲁基亚，基拉帝纳以及丘雷姆。这样下去城市就危险了。

胡帕为了守护城市，从光轮中召唤出新的传说中的口袋妖怪来！小智同胡帕召唤的口袋妖怪能一同守护住迪塞尔市吗？邪恶力量的正体又是。

传说VS传说。

口袋妖怪史上最壮绝的战斗开始了。